「光明之心」的故事始于某一天，一位神秘少女輝夜在溫達(dá)利亞島的海岸上被男主角里克發(fā)現(xiàn)，其后更發(fā)現(xiàn)她的記憶和感情均已失去，而通過與島上居民進(jìn)行心靈交流，輝夜也一點(diǎn)點(diǎn)地取回了感情。與此同時(shí)，本身和平的溫達(dá)利亞島卻引來了大量的海賊，原來這些海賊的目的都是想拿走輝夜頸上戴著的靈石。